קשרי ידידות והערכה אמיתיים שררו בין הגאון רבי יששכר מאיר זצוק"ל, ראש ישיבת הנגב, לבין מרן זיע"א.
תלמידיו ושומעי לקחו מספרים כי ראש הישיבה היה משנן באוזניהם תדיר בשבחו של מרן זיע"א, והיה אומר: "אנחנו לא מבינים מי זה מרן הרב עובדיה (שליט"א), אין לנו מושג על גדלותו הענקית בתורה, ואוי לו לאותו אדם שלא מכבד אותו!…".
תמיד היה ראש הישיבה מתהדר ואומר כי זכות עצומה וגדולה נפלה בחלקו שמרן שולח לו את ספריו וחיבוריו בתוספת הקדשה אישית, וכבוד גדול ועצום הוא לו שספרייתו מתהדרת בספריו של מרן אשר שוכנים בה כבוד.
(משוש תבל).